除了(或以及)包括來自存儲庫的外部源二進位 APK,可以直接從原始程式碼構建程式。

使用此方法，可以驗證應用程式構建是否正確，是否與原始碼相對應，是否只包含自由軟體。不幸的是，在 Android 世界中，以二進制 APK 形式提供應用程式並聲稱自己是自由軟體似乎司空見慣，它，然而實際上，以下部分甚至全部都是事實：

1. 該原始碼（或許是某特定版本的，甚或是全部版本的！）無法取得或不完整。
2. 該原始碼無法產生實際提供的二進制碼。
3. 該「原始碼」包含不明來源或專屬授權的二進制檔案。

因此，從原始碼構建應用程式為 F-Droid 主軟體庫的首選方法，儘管偶爾出於技術或歷史原因，也有例外。

從原始碼編譯時，應注意，你需使用自己的密鑰對應用程式簽名（所有 APK 必須經過簽名才能在 Android 上安裝）。如果裝置已安裝某個應用程式，升級至使用不同密鑰簽名的新版本時，需首先卸載該應用程式。這可能對用戶帶來不便，因為卸載將導致與已安裝應用程式相關聯資料的丟失。

管理從原始碼編譯的應用程式的軟體庫的流程與《簡單二進制軟體庫》章節中的說明非常相似，不過還需：

1. 包含 Build 條目至中介資料檔案。
2. 執行 fdroid build 來構建任何尚未構建的應用程式。
3. 執行fdroid publish完成封裝，並對所有已構建的 APK 進行簽名。

應用程式的資料目錄，即 fdroiddata

開始之前，你需要至少一個軟體庫資料目錄。在這個目錄下，可執行 fdroid 指令執行所有軟體庫管理任務。可以建立全新的資料，或者復制 F-Droid 主軟體庫使用的資料：

git clone https://gitlab.com/fdroid/fdroiddata.git

無論如何使用這些工具，總是需要設定一些基本的配置細節：這可透過在資料目錄中建立名一個為 config.yml 的檔案來完成。你應該從 fdroidserver 專案中復制示例檔案 (./examples/config.yml) 至你的資料目錄，然後根據其中的說明進行編輯。

按照這種方式設定之後，即可透過 fdroid 指令存取這些工具的所有功能。不加參數執行該指令可顯示一個可用的子指令的清單。

任何指令後加上 --help 可獲取該指令可用的附加選項清單。

fdroid update --help

有關 fdroid build 的更多資訊

在不加任何參數的情況下執行時，fdroid build 將構建所有不在 repo 目錄（準確地說，unsigned 目錄）中的應用程式版本。你還可以做其他各種事情。和所有工具一樣，--help 選項很有幫助，以下為一些常見用途的附有註釋的示例和說明：

為構建單一應用程式的單一版本，你可以執行如下指令：

fdroid build org.fdroid.fdroid:16

該指令用於編譯版本代碼 16（即 0.25 版本）的 F-Droid 客戶端。這些工具中許多可將參數識別為包，以便其活動僅限於特定一組包。

編譯成功後，unsigned 目錄將生成兩個檔案：

org.fdroid.fdroid_16.apk
org.fdroid.fdroid_16_src.tar.gz

第一個檔案是（未簽名的）APK。你可以使用除錯密鑰簽名，然後直接在裝置或模擬器中進行測試。第二個檔案是原始碼 tarball，其中包含生成二進制所用的原始碼。

如果你想要發布這些檔案，請執行：

fdroid publish

原始碼 tarball 將移動到 repo 目錄（這是你將要推送到你的 Web 伺服器的目錄）。 APK 的已簽名和壓縮對齊版本也將出現在那裡，並且這兩個檔案將從 unsigned 目錄中被刪除。

如果你純粹是為了測試而構建，並且不打算將結果推送到軟體庫中，至少現在還不打算推送，那麼可以使用 --test 選項將輸出指向到 tmp 目錄，而不是 unsigned 目錄。類似的效果可以透過在構建後簡單地刪除 unsigned 目錄中的輸出檔案來實現，但你可能會忘記這麼做！

與此相似（並僅在與 --test 同時使用時，你可以使用 --force 強制構建 Disabled 的應用程式，一般它會被直接忽略。被發現包含 ELF 或已知非自由庫的版本也可以被強制構建。參見 — 構建_章節中的 _scanignore 和 scandelete。

如果構建未成功，你可以檢視 _logs/ 檔案夾中的輸出回饋原因。如果這樣仍未找到原因，嘗試用常規的方法逐步構建應用程式：android update project, ndk-build, ant debug。

請注意，原始碼軟體庫通常包含預構建庫。如果想要在 F-Droid 主軟體庫發布該應用程式，那麼所有這些預構建庫都必須透過中介資料或由可信的第三方構建，這點非常重要。

在應用程式原始碼中執行 fdroid build

使用 fdroid build 的另一種選擇是使用一個中介資料檔案，該檔案包含在應用程式的原始碼中，而不是在一個有很多其他應用程式的 metadata/ 目錄中。 .fdroid.yml 中介資料檔案應當位於軟體庫的根目錄下。

設定完成之後，你可以透過執行以下指令使用整個 F-Droid 技術棧構建最新版本應用程式：

fdroid build

如需構建每一個版本，可指定 --all 選項。

直接安裝

你還可以使用 fdroid install 指令構建並直接安裝到所連接的裝置或模擬器上。如果在不將包作為參數傳遞的情況下執行此操作，則將安裝每個包的所有最新構建和簽名版本。在大多數情況下，這不是你想要做的，因此將直接終止該指令執行。但是，如果你確定這是你想要的，你可以透過使用 ---all 來覆蓋這一規則。請注意，當前該模式不執行完整性檢查，因此，如果已簽名輸出目錄中的檔案被修改，你不會被提示。